Monseñor Juan José Gerardi fue asesinado en el garaje de la casa parroquial de la Iglesia de San Sebastián dos días después de haber presentado el Informe de Recuperación de la Memoria Histórica (REMHI). Actualmente en ese mismo lugar hay un mural que narra algunos momentos de la vida de monseñor y un pequeño museo con fotos familiares y algunas de sus pertenencias. En el parque de San Sebastián se construyó un monumento en su memoria.